感染性疾病是全世界范围内威胁人类健康的一类主要疾病。近年来,造成感染的病原微生物日益复杂,涂片镜检、培养等传统检测方法存在处理过程复杂、花费时间长、可检测病原体种类少等缺点,仍有25%--60%的病原微生物不能明确诊断。
而宏基因组二代测序技术(metagenomics next generation sequencing, mNGS)是一种基于二代测序技术的无需培养、无偏好性的病原检测技术,通过对临床样本中直接提取的DNA和/或RNA进行高通量测序,再经过数据库比对与生物信息学分析,可一次性完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体检测,实现感染性疾病的精准诊断。
据悉,予果生物是是国内最早将游离核苷酸(cell-free)宏基因组高通量测序技术(mNGS)转化于临床的的企业。公司检测范围涵盖23943种病原微生物,累计检测临床样本量已近10万例。
予果生物创始人&CEO夏涵介绍,2017年成立以来,短短四年时间,予果实现了快速发展。公司人员从3人扩展到将近500人,营收规模也从最开始的10万元增加今年的预计1亿元。
此外,截止今年年中,予果已经累计完成5.2亿元融资,投资人囊括北极光创投、龙磐资本、辰德资本、创新工场、LYFE等该领域最知名机构。
数字化让病原诊断更简单
近年来,随着耐药病原微生物的增多、少见病原微生物的出现以及免疫抑制或受损宿主的增加,感染的发病率和死亡率仍居高不下,严重感染患者病死率高达50%。
夏涵认为,数字化诊断一定是未来病原诊断的主要的形式,“运用数字化诊断我们从每一个样本里面获得的数据量现在是成百上千倍,甚至是上亿倍的增长”。
据介绍,予果已成功研发出国内首款云端病原微生物数据分析系统 PACE(Pathogen Capture Engine)。基于该引擎,可对临床样本(脑脊液、血液、肺泡灌洗液、无菌体液、组织等)进行病原微生物DNA及RNA序列测定。在此基础上予果研发出的高通量基因检测方案依托强大的基因数据库和多组学数据库,结合AI技术,可以显著提高诊断的准确性,是当下病原诊断领域最具创新的数字化解决方案。
予果研发团队原创的生信算法PACEseq HUGO-DNA也于近日获得了HICOOL全球创业大赛一等奖。据悉,HICOOL全球创业大赛是以海内外人才创业大赛为主体的综合性国际人才活动,大赛打通并建立了海外人才和本土人才来京创新创业的双流通道。同时,HICOOL围绕创业项目“发掘-落地-孵化-融资-转化”的普遍生命周期,着力构建大赛/峰会、产业园、管家、基金、在线平台、商学院“六位一体”创新创业生态平台。
公开资料显示,PACEseq HUGO-DNA可以剔除约99%的背景微生物,同时保留样本中真实存在的微生物,很好解决了如何鉴定并去除背景微生物这一目前困扰业界最大的难题。
未来3年研发投入占比不低于30%
新冠疫情的爆发,推动了mNGS应用在中国的快速发展。据不完全统计,仅2020年1年mNGS领域就发生了8起融资事件。
夏涵表示,资本的进入加速了市场的发展,竞争对手的布局也让mNGS领域变得热闹起来。但不管市场是低迷还是热闹,予果会一直坚守“让病原诊断更简单”这个使命,踏踏实实去做研发。
夏涵称,予果生物今年研发投入大约有7000万,明年还会继续加大投入,预测到2024年之前研发投入占比都不会低于30%。予果生物目前能将生信分析和mNGS有效结合,形成较高的技术和数据壁垒。公司未来一段时间仍会专注于研发,做好产品的升级,推动以测序技术做病原诊断市场的发展。等未来产品丰富到一定程度的时候,会考虑资本化的问题。
夏涵强调,病原诊断市场是需要不断投入资金进行研发,从而形成技术迭代使得诊断结果更快速更精准,更利于市场成长;如果仅凭一个固化的产品,那公司优势很快就会没有,技术发展停滞不利于市场趋于成熟和发展,很快就会进入趋同化的价格战的通道。特别是在资本涌入的这样一个市场里面,如果一个公司没有持续创新和研发的能力,那就一定会只能剩下价格这个武器了。
谈及mNGS在中国的进一步发展,夏涵提到了三个关键点。第一是需要出台行业标准,能够使市场更加规范化;
第二是需要持续的研发投入。夏涵希望行业能够更加稳健的发展,更专注行业的技术提升而不是过早进入价格战,以坚实的科技创新实现行业良性增长,为新市场的科技型企业争取成长空间。“如果说全部当自来水来卖的话,那谁去做创新呢?”
第三是需要加大行业人才的培养。夏涵称,在这个行业里面我们没有先例可参考,这意味着其实在美国也好,在欧洲也好,现阶段并没有那么多相关人才,所以对我们来说是一个挑战,但更是一个机会,予果持续的科技创新可以为人才提供较好的成长空间。
夏涵也非常看好市场未来的发展。“随着人口的老龄化的增长,mNGS前沿技术研发的逐渐成熟,临床验证后可大规模进行市场转化,未来mNGS市场会远超500万人份的检测规模,随着时间的推移实现成本下降,容纳1~2个上市公司绰绰有余。”
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